Zakażenie matka - dziecko

Pomimo, że genitalne typy wirusa HPV mogą być w czasie porodu przekazane z matki na dziecko, pojawienie się chorób związanych z wirusem HPV u noworodków jest rzadkością. Jeśli wirus HPV typu 6 lub 11 zostanie przetransportwany na dziecko może mieć wpływ na rozwój niemowlaka - powodując nawracającą brodawczakowatość dróg oddechowych (JORRP). JORRP występuje bardzo rzadko. Choć wskaźniki JORRP są znacznie wyższe, gdy kobieta w czasie porodu cierpi na wysyp brodawek narządów płciowych, nawet w tych przypadkach ryzyko JORRP jest wciąż niższe niż 1%.

Zakażenie narządów płciowych

Ponieważ niektóre z typów wirusa HPV atakujące żeńskie narządy płciowe są związane z rozwojem raka szyjki macicy to one cieszą się największym zainteresowaniem naukowców. 

Zakażenia HPV tymi typami wirusów mają miejsce głównie w trakcie aktywności seksualnej.

Zidentyfikowano co najmniej 40 typów HPV, które mogą zainfekować drogi rodne. Prezerwatywy nie chronią w pełni przed wirusem, ponieważ nie przykrywają one okolic narządów płciowych, w tym wewnętrznej powierzchni ud, które pozostają narażone na kontakt z zakażoną skórą.

Infekcje jamy ustnej

Badania przeprowadzone z udziałem zdrowych ochotników wykazały rakotwórczego wirusa HPV u 3,5% badanych i wirusa HPV16 u 1,3%. Mężczyźni mają większą częstość występowania HPV jamy ustnej niż kobiety.

Zakażenie jamy ustnej wirusem HPV  ma związek z występowaniem raka jamy ustnej i gardła. Szanse na zakażenie wzrastają wraz z liczbą partnerów, z którymi praktykowano zarówno sex oralny jak i całowanie. Nie seksualne infekcje jamy ustnej poprzez transmisję śliny są również możliwe.

Współdzielone przedmioty

Używanie zanieczyszczonych wirusem HPV przedmiotów może prowadzić do zarażenia. Możliwa choć niezwykle rzadka jest HPV infekcja kobiecych genitalii spowodowana czynnikiem innym niż stosunek seksualny. Kontakt palce-genitalia jest możliwym ale rzadkim sposobem transmisji.